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생물정보학90

[한주현의 Genome Mining] "일루미나" 팩바이오를 1조3500억원에 인수 ` 안녕하세요 한주현 입니다! 오늘은 큰 뉴스를 하나 들고왔습니다! DNA Sequencing Giant Illumina Will Buy Pacific Biosciences For $1.2 Billion - Exclusive CEO Interview https://www.forbes.com/sites/matthewherper/2018/11/01/dna-sequencing-giant-illumina-will-buy-pacific-biosciences-for-12-billion--exclusive-ceo-interview/#4ba679007c78 일루미나(Illumina)일루미나는 현재 숏리드(short read, 101bp 또는 151bp) 시퀀싱에 있어 전세계 1위 기업입니다. 시퀀싱 기술발전에 큰 기여.. 2018. 11. 2.
[한주현의 Genome Mining] 쌍둥이의 methylation? - epigenetics, 후성유전학 안녕하세요 한주현의 Genome Mining 입니다! 오늘은 "쌍둥이의 methylation? - epigenetics 후성유전학" 에 대해 써보겠습니다. 우리가 자라면서 키, 몸무게, 질병 등의 신체적인 특징과 성격, 우울증 등의 정신적인 특징은 어디에서 오는 것일까요? 크게 두 가지로 나눠보자면 "유전적인 요인" 또는 "환경적인 요인"이 있을 것입니다. 이러한 궁금증의 해답을 찾기 위해 연구자들은 쌍둥이에 대한 연구를 진행하였는데요, 최근 쌍둥이에 대한 DNA Methylation을 연구한 논문이 발표되었습니다. 왜 DNA Methylation을 연구하였을까요? 1. 후성유전학(Epigenetics)과 DNA Methylation 아래 그림에서 공을 굴리면 어느 쪽으로 흘러갈까요?굴려봐야 알겠지만, .. 2018. 8. 7.
[한주현의 Genome Mining] DNA 정보의 활용, 23andMe와 GSK 안녕하세요 한주현의 Genome Mining 입니다! 오늘은 "DNA 정보의 활용, 23andMe와 GSK" 라는 주제로 컬럼 작성을 해보고자 합니다. 1. 빅딜 (Big Deal) 2018년 7월 25일 미국 제약회사 gsk(GlaxoSmithKline)가 23andMe에 300만 달러(원화 약 33억 8,400만 원)를 투자하며 연구개발 제휴를 체결하였습니다. GSK와 23andMe 제약회사가 SNP 기반 유전자 D2C(Direct to Consumer) 회사에 거금을 투자한 것에 의의는 무엇일까요? 23andMe는 타액(침, saliva)을 기반으로 내가 가지고 있는 유전적 질환 여부, 카페인 대사, 탈모, 기미 등과 같은 유전적 특성을 레포팅 해주는 회사입니다. 그런데 제약회사가 이렇게나 큰돈을 .. 2018. 8. 4.
[한주현의 Genome Mining] NGS 산업 시장 알아보기 안녕하세요 한주현입니다. ^^ 오늘의 Genome Mining의 주제는 "NGS 시장 알아보기" 입니다. 제가 쓰는 첫 번째 Genome Mining 칼럼이므로 제 소개 먼저 하고 진행해 보겠습니다 1. 한주현 소개 저는 생물정보학자로, 2018년 현재 마크로젠 데이터분석부에서 Human Sequencing 분석을 주 업무로 맡고 있습니다. NGS Sequencing을 단계별로 표현하자면 아래와 같습니다. NGS Sequencing 단계 샘플 -> 라이브러리 -> 시퀀서 -> rawdata -> Readable Variant Calling Format -> 연구 1) 시퀀싱 하고 싶은 샘플을 채취하여2) 샘플을 시퀀서 기계가 읽을 수 있도록 라이브러리를 제작하고3) 시퀀서에 돌리면4) A, C, G, T.. 2018. 8. 4.
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