반응형 설치7 [생물정보학 유튜브 강의] 생물정보학 툴 설치 (samtools) 및 bam 파일 보는 방법 안녕하세요 한주현 입니다. 생물정보학 유튜브 강의를 하나 더 제작하였습니다. 오늘은 "생물정보학 리눅스 툴 설치 (samtools) 및 bam 파일 보는 방법" 의 주제로 포스팅해보겠습니다. 생물정보학을 처음 접하고, 리눅스를 처음 접한 생물정보학 꿈나무라면, 리눅스에서 툴 설치는 큰 산으로 다가올 수 있습니다. 동영상 강좌가 도움이 되셨으면 좋겠습니다. 오늘은 생물정보학에 처음 입문하시고 리눅스가 익숙치 않으신 분들을 위해, 생물정보학 툴 중 하나인 samtools를 설치하고 bam 파일을 보는 방법에 대해 유튜브 동영상을 만들어서 업로드 해보았습니다. 유튜브 구독과 좋아요 많이 부탁드릴게요! 그럼 담에 또 만나요~~ 2020. 6. 14. [바이오파이썬] 바이오파이썬 설치와 jupyter notebook에서 실행하는 방법 안녕하세요 한주현 입니다. 오늘은 "바이오파이썬 설치와 jupyter notebook에서 사용 방법" 의 주제로 포스팅해보겠습니다. 바이오파이썬과 같은 파이썬 라이브러리를 설치하는 방법이 어렵지는 않습니다만 초심자에게는 자세히 설명해주는 내용을 찾아보기 힘들기에 글 보다는 따라하기 쉬운 동영상으로 제작하였습니다. 제가 처음 파이썬 프로그래밍을 할 때를 생각하며 제작해보았습니다. 저 또한 처음에는 어려움들을 겪으며 여러 방면으로 구르며 시행착오를 많이 겪었었습니다. 이러한 마음으로 앞으로 시리즈 영상을 계속 제작해보려 합니다. 구독과 좋아요 로 많은 응원 부탁드리겠습니다 :) 프로그래밍 또는 생물정보학을 시작하시는 여러분들께 도움이 되셨음 좋겠습니다. 오늘은 생물정보학에 처음 입문하시거나 파이썬이 익숙치 .. 2020. 6. 7. [Tool] BLAST 리눅스 로컬 설치 및 실행방법 - BLAST LINUX local install and execute - BLAST 로컬 설치의 장단점 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 BLAST를 로컬에 설치하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 목차 1. BLAST 로컬 설치의 장단점 2. BLAST 로컬 설치 및 실행 1. BLAST 로컬 설치의 장단점 BLAST는 NCBI에서 제공하는 툴로 서열을 넣어주면 데이터베이스와 비교하여 서열에 대해 종을 찾아주는 아주아주 유용한 툴입니다. 일반적으로 우리는 BLAST를 NCBI에서 제공하는 페이지, 즉 웹에서 접근해서 사용하는데요 이런 페이지입니다 ㅎㅎ.. 웹에서 하면 편하긴 한데.. 연구나 분석을 하다보면 GUI환경이 아닌 터미널 CLI 환경에서 진행해야 할 경우가 많습니다. 왜냐하면 웹에서 하나씩 서열을 붙여넣어서 할 수도 있지만, 10,000개나 되는 서열을 BLAST 해야 한다면 10,000번 동안 하고.. 2018. 12. 8. [bedtools] bedtools 설치 방법 - How to install bedtools 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 bedtools 설치방법에 대해서 말씀드리겠습니다. bedtools는 UNIX(LINUX)나 OSX machine 에서 사용가능합니다. source code 설치 방법$ wget https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/download/v2.25.0/bedtools-2.25.0.tar.gz $ tar -zxvf bedtools-2.25.0.tar.gz $ cd bedtools2 $ make 기본적으로는 /usr/local/bin 에 설치가 됩니다. 소스코드 설치가 어려우신 분 들은 아래를 참고하시면 됩니다. Centos$ yum install BEDTools Ubuntu$ apt-get install bedtools 참고 URLhttp.. 2017. 4. 4. 이전 1 2 다음 반응형
