반응형 생물정보학90 [생물정보학 알고리즘] 배열에서 최대값, 최소값 찾기 - 파이썬 알고리즘 공부, 자바 알고리즘 학습 안녕하세요 한주현 입니다. 목차 (계속하여 업데이트될 예정) 1. 1 부터 n 까지 합 구하기 - korbillgates.tistory.com/1902. 배열에서 최대값, 최소값 찾기 - korbillgates.tistory.com/204 오늘 알아볼 알고리즘은 배열에서 최대값, 최소값 찾기 입니다. 알고리즘 생각 1. 최대값, 최소값을 담을 수 있는 변수에 배열의 가장 첫 번째 항목을 넣음. 2-1. 최대값의 경우 for 문으로 항목을 돌아가며 최대값 변수에 담긴 수 보다 항목이 크면 최대값 변수에 새로운 항목을 집어 넣음 2-2 최소값의 경우for 문으로 항목을 돌아가며최소값 변수에 담긴 경우 보다 항목이 작으면 최소값 변수에 새로운 항목을 집어 넣음 파이썬 스크립트 123456789101112131.. 2018. 12. 29. [바이오파이썬] 5.1.1 SeqIO 모듈로 서열 파일 읽기 - FASTA 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 SeqIO 로 파일읽는 방법에 대해 알아보겠습니다. SeqIO로는 FASTA, FASTQ, GenBank 등의 파일을 읽을 수 있는데 오늘은 SeqIO의 메서드와 FASTA 파일 읽기를 살펴보겠습니다. 목표 SeqIO 모듈의 Sequence 파일을 읽는 두 가지 메서드인 SeqIO.read(), SeqIO.parse()에 대해 알아보겠습니다. SeqIO 모듈을 활용하여 FASTA 파일을 읽는 방법에 대해 알아보겠습니다. 준비물 오늘은 준비물이 없습니다 ㅎㅎ 예시 파일은 우리가 그냥 메모장으로 만들어봐요~ SeqIO의 두 가지 메서드 SeqIO 모듈을 가지고 Sequence 파일을 읽을 때 두 가지 메서드가 있습니다. SeqIO.read() SeqIO.parse() 간단히 .. 2018. 12. 24. [Tool] BLAST 리눅스 로컬 설치 및 실행방법 - BLAST LINUX local install and execute - BLAST 로컬 설치의 장단점 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 BLAST를 로컬에 설치하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 목차 1. BLAST 로컬 설치의 장단점 2. BLAST 로컬 설치 및 실행 1. BLAST 로컬 설치의 장단점 BLAST는 NCBI에서 제공하는 툴로 서열을 넣어주면 데이터베이스와 비교하여 서열에 대해 종을 찾아주는 아주아주 유용한 툴입니다. 일반적으로 우리는 BLAST를 NCBI에서 제공하는 페이지, 즉 웹에서 접근해서 사용하는데요 이런 페이지입니다 ㅎㅎ.. 웹에서 하면 편하긴 한데.. 연구나 분석을 하다보면 GUI환경이 아닌 터미널 CLI 환경에서 진행해야 할 경우가 많습니다. 왜냐하면 웹에서 하나씩 서열을 붙여넣어서 할 수도 있지만, 10,000개나 되는 서열을 BLAST 해야 한다면 10,000번 동안 하고.. 2018. 12. 8. [근황] 서울여대 생물정보학 강의 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 저의 근황에 대해서 얘기해보겠씁니다 ㅎㅎ 근황 1. 추운 날씨와 뱅쇼 2. 서울여대 생물정보학 강의 1. 추운 날씨와 뱅쇼 날이 상당히 춥습니다 ㅜㅜ 재난 안전 앱에서 조심하라고 알람이 올정도군요 ㅜㅜ 추운날에는 역시.. 뱅쇼입니다. (무알콜) 투썸플레이스에서 파는 뱅쇼인데 여러 재료가 많이 들어있습니다 ㅎㅎ 맛있네요 :) 2. 서울여대 생물정보학 강의 2018년 12월 초, 서울여대 김명겸 교수님의 초청으로 학생분들께 생물정보학에 대해 실무에서 진행하는 분석 파이프라인에 대해 강의를 진행하였습니다. 자세한 강의 내용은 다음 URL로 갈음합니다. https://kennethjhan.github.io/Genome-Analysis-Tutorial/ 실무에서 사용하는 분석 파이.. 2018. 12. 8. 이전 1 ··· 5 6 7 8 9 10 11 ··· 23 다음 반응형
