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Python27

[Python] ImportError: No module named req 원인, 해결 방법 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 ImportError: No module named req 가 발생하는 원인, 그리고 그 해결 방법에 대해 알아보겠습니다. 문제 상황 Python을 작업하는 개발자 대부분은 99.999% (100% 는 아니겠지만..) 아주 높은 확률로 python3로 작업을 하시겠지만, 옛날에 진행된 프로젝트의 github repository를 다운받아서 툴을 설치하게 되면 python2로 만들어진 뒤 repo가 관리가 안되어서 어쩔 수 없이 python2로 수행해야 하는 경우가 있습니다. python2를 통해 다운받은 github repository의 setup.py를 아래와 같이 수행하여 설치할 수 있는데, ㅤ $ python2 setup.py install ㅤ ImportError:.. 2023. 8. 13.
[생물정보학] FASTA gzip 파일 읽기 - 염색체 별로 염기 숫자 세기 - UCSC FASTA 다운로드 - 자바 JAVA , 파이썬 Python, 파일 읽기 속도 비교 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 자바, 파이썬으로 FASTA gzip 파일을 읽어 염기서열을 세는 프로그래밍을 해보겠습니다. 목차 1. UCSC FASTA 파일 다운로드 2. 염색체 별로 읽기3. Python 스크립트 구현4. JAVA 코드 구현5. 결과6. 파일 읽기 속도 비교 - JAVA, Python 1. UCSC FASTA 파일 다운로드 - chromosome 별 다음 경로에 들어가서 chromosome 별로 fa.gz 파일을 받습니다. hg38 http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38/chromosomes/ hg19http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg19/chromosomes/ 사이트에 접속하시면 다음과 같은 .. 2018. 11. 14.
[python] 파이썬 pickle 피클 활용법 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 python의 pickle 을 활용하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 들어가며 - pickle 은 무엇? 언제 쓰나요? 파이썬 피클에 대해서 알아봅시다 ㅎㅎ 텍스트 상태의 데이터가 아닌 파이썬 객체 자체를 파일로 저장하는 것 입니다. 그러면 무엇이 좋나요? 만약 우리가 10GB 짜리 raw text 파일을 파싱하여 필요한 부분을 빼내서 사용한다고 해봅시다 raw text 에 있는 내용을 프로그램을 돌릴 때 마다 파싱하여 필요한 부분을 뺀다면 비효율 적이겠죠? 그래서 미리 필요한 부분을 딕셔너리 던, 리스트 던, 튜플 이던 저장을 해놓는 것 입니다.. 근데 문자열이 아닌 객체를 파일에 쓸 수 없기에, pickle 모듈을 활용해 그 객체 자체를 바이너리로 저장하는 것 입니다 !.. 2018. 7. 7.
[뱀뱀이 프로그래밍 만화] 파이썬 피클 만화 - python pickle cartoon 안녕하세요 한주현 입니다 :) 오늘은 python pickle 모듈 에 대해서 그려보았습니다. Pickle 파이썬 객체 자체를 파일로 바이너리 형태로 저장 할 수 있습니다 ㅎㅎ 피클을 load 할 때는 pickle.load(파일) 피클을 save 할 때는 pickle.dump(객체, 파일) 로 합니다 ㅎㅎ 피클이 왜 사용하는지에 대한 내용은 다음 url 을 참고해 주세요 http://korbillgates.tistory.com/173 파이썬 pickle 모듈에 대해 그려보았습니다 ㅎㅎ 그럼 다음에 또 만나요~~ 기부 버튼을 만들었습니다여러분들의 작은 정성이 저에게 큰 힘이 됩니다기부해주신 분들을 기억하며더 좋은 내용으로 보답해 드리겠습니다 :) Donate 버튼은 paypal 결제로 paypal 계정이 .. 2018. 7. 7.
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