반응형 2018/0619 [뱀뱀이 프로그래밍 만화] Pileup Read - 생물정보학 안녕하세요 한주현 입니다 :) 오늘은 생물정보학 포맷 개념 중 하나인 pileup 에 대해서 그려보았습니다. Pileup pileup 은 기준이 되는 서열에 sequencer (샘플로 부터 염기서열을 읽는 기계) 에서 나온 Read(리드, sequencer 가 한 번 동안에 읽은 서열)를 잘~ 맞게 붙여서 만든 파일 (sam 또는 bam 파일)에서 쌓아 올라가는 방식으로 read를 표현한 포맷 입니다 ㅎㅎ... 어려운데 말 또한 기네요;; ㅜㅜ GATK 로 해당 파일을 생성해 낼 수 있습니다. 다음 링크를 참고해 주세요 ㅎㅎ 링크 : http://korbillgates.tistory.com/165 어려운 내용 쉽게 풀어보고자 열심히 그림을 그려보고 있습니다!! 꼭 도움이 되셨으면 좋겠네요 ㅎㅎ 생물정보학.. 2018. 6. 21. [GATK] pileup 파일 얻기 - bam 에서 쌓인 read base 얻기 - gatk pileup 분석 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 GATK의 툴 중 하나인 Pileup 에 대해 알아보겠습니다. Pileup 이란? pileup 은 말 그대로 쌓아 올린것을 의미합니다 ㅎㅎ Reference 서열에 맞춘 read 들을 쭉~ 쌓아 올린 것을 pileup 이라고 하지요 그림을 하나 그려봤습니다 ㅎㅎ.. 뱀뱀이 프로그래밍 만화도 많이 봐주세요 ㅎㅎ 링크 : http://korbillgates.tistory.com/category/뱀뱀이 프로그래밍 만화/단편작 참고로 아래는 쌓인 read 들을 보여주는 여러가지 소프트웨어 입니다 ㅎㅎ IGV (Integrative Genomics Viewer) - Broad Institute Samtools tview GATK Pileup - GATK3.x , GATK4 GATK.. 2018. 6. 21. [뱀뱀이 프로그래밍 만화] C Hello world - 그림 안녕하세요 한주현 입니다 :) 오늘은 C 언어의 Hello world 에 대해 그려보았습니다 ㅎㅎ C Hello World C 언어의 Hello World 에 대해 그려보았습니다 ㅎㅎ 그럼 다음에 또 만나요~~ 기부 버튼을 만들었습니다여러분들의 작은 정성이 저에게 큰 힘이 됩니다기부해주신 분들을 기억하며더 좋은 내용으로 보답해 드리겠습니다 :) Donate 버튼은 paypal 결제로 paypal 계정이 없으시더라도카드로도 기부 가능하십니다 :)Use your credit card or bank account (where available). 옆의 continue 를 누르시면 됩니다 한주현 드림 2018. 6. 19. [IT 리뷰] 샤오미 스마트 멀티탭 리뷰 장단점 - 콘센트 변환기 - 휴대폰으로 전원을 껐다 켰다 - 전원 원격 조종 안녕하세요 한주현 입니다 :) 오늘은 제가 최근에 구매한 샤오미 스마트 멀티탭에 대해 리뷰해보겠습니다. 샤오미 스마트 멀티탭 지난번 태국 여행 때 예쁜 전등이 있어서 사왔습니다만 코드 규격이 달라서.. 앞에 돼지코를 붙여야 쓸 수 있는 상황이었습니다 집 앞에 철물점에서 1,000원 주고 살 수도 있었지만,,, ㅋㅋ 친구가 샤오미 멀티탭을 사보는것 어떻겠냐고 말하여 바로 검색 ..ㅋㅋㅋ 중국 직구로 샀습니다 ㅋㅋ 대략 4일 정도 걸려서 배송 완료 ㅎㅎ 뭔가 노란 테이프로 칭칭 감겨서 왔습니다.. ㄷㄷ 붉은 한자가 느낌있게 써져 있습니다 개봉을 하니 이렇게 생겼습니다 두 개를 샀습니다 ㅋㅋ 박스에 노란 테이프 때문에 변환 젠더 플러그에 끈끈이가 묻었습니다 ㅜㅜ... 뭐 쓰는데 지장만 없으면 되죠..ㅋㅋ 개봉.. 2018. 6. 19. 이전 1 2 3 4 5 다음 반응형
