반응형 생물정보학/Tools43 [GATK] GATK4 Launch 행사 - Broad Institute GATK4 Launch 안녕하세요 한주현입니다 EST 1월 9일 오후 2시에 GATK 4 Launch를 Facebook Live로 진행한다는 소식이 있습니다. Live는 2시간정도 진행되며 facebook 주소는 아래와 같습니다 https://www.facebook.com/broadinstitute 한국시간으로는 1월 10일 오전 4시부터 오전 6시 까지입니다 ㅎㅎ;; 어떠한 점들이 바뀌었는지 직접 라이브로 보려면 일찍 일어나야겠군요! 그럼 Launch 행사 보시고 찾아뵙겠습니다 ㅎㅎ 2018. 1. 8. [samtools] sam, bam 파일간 변환 방법, sam to bam , bam to sam 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 samtools로 sam, bam 파일간 변환 방법 에 대하여 알아보겠습니다. samtools samtools 로 SAM, BAM 간 파일 변환 - 준비물 준비물 1) samtools samtools 설치가 되어 있지 않다면 다음 링크들을 참고해 주세요 - samtools 공식 다운로드 페이지 http://www.htslib.org/download/ - samtools 설치 방법 http://korbillgates.tistory.com/57 2) 실습 bam 파일 http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/wgEncodeUwRepliSeq/wgEncodeUwRepliSeqBg02esG1bAlnRep1.bam Siz.. 2017. 12. 12. [LINUX] FASTQ에서 random read 골라내기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 FASTQ에서 random하고 read1, read2 pair에 맞춰서 read를 골라내는 방법 에 대하여 알아보겠습니다. LINUX command 사용 FASTQ에서 random read 골라내기 - 준비물 준비물1) LINUX (Ubuntu, CentOS 등)linux 명령어를 사용하여 진행합니다. 2) 실습 FASTQ 파일https://raw.githubusercontent.com/KennethJHan/blogdata/master/read_1.fastqhttps://raw.githubusercontent.com/KennethJHan/blogdata/master/read_2.fastqSize: 2.5KB, 2.5KB 실습파일은 제가 그냥 10개의 read pair로 만.. 2017. 12. 7. [samtools] BAM 파일을 FASTA, FASTQ 파일 형식으로 변환하기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 samtools로 BAM파일의 정보를 가지고 FASTA, FASTQ 파일 형식으로 바꾸는 방법 에 대하여 알아보겠습니다. samtools samtools 로 BAM 파일에서 FASTA, FASTQ 파일형식으로 변환 - 준비물 준비물1) samtoolssamtools 설치가 되어 있지 않다면 다음 링크들을 참고해 주세요 - samtools 공식 다운로드 페이지http://www.htslib.org/download/ - samtools 설치 방법http://korbillgates.tistory.com/57 2) 실습 bam 파일http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/wgEncodeUwRepliSeq/wgEncode.. 2017. 11. 22. 이전 1 ··· 4 5 6 7 8 9 10 11 다음 반응형
