반응형 생물정보학/Tools43 samtools 설치하기 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 samtools 설치에 대하여 알아보겠습니다 참조 URL http://www.htslib.org/doc/samtools.html http://www.htslib.org/download/ 다음 URL에 들어가시거나 http://www.htslib.org/download/ 또는 제가 아래에 준비한 링크를 직접 받으셔도 됩니다 다운로드 링크 https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.3.1/samtools-1.3.1.tar.bz2 이제 본격적으로 설치해보죠.. 1) 압축해제$ tar xf samtools-1.3.1.tar.bz2 2) 설치$ make$ make prefix=경로지정 install 설치과정 Makefile:.. 2017. 3. 14. bcftools 설치하기 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 bcftools 설치에 대하여 알아보겠습니다 참조 URL http://www.htslib.org/doc/bcftools.html http://www.htslib.org/download/ 다음 URL에 들어가시거나 http://www.htslib.org/download/ 또는 제가 아래에 준비한 링크를 직접 받으셔도 됩니다 다운로드 링크 https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.3.1/bcftools-1.3.1.tar.bz2 이제 본격적으로 설치해보죠.. 1) 압축해제$ tar xf bcftools-1.3.1.tar.bz2 2) 설치$ make$ make prefix=경로지정 install 설치과정 cd htslib.. 2017. 3. 14. VCF 파일의 indexing 하기 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 VCF 파일의 indexing 방법에 대하여 알아보고자 합니다 VCF파일에 대한 간단한 설명은 아래 링크를 참조해 주세요 https://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf # Command Line $ bgzip -c sample.vcf > sample.vcf.gz $ tabix -p vcf sample.vcf.gz # Resultsample.vcf.gz.tbi bgzip 또는 tabix 의 설치에 관한 링크는 다음을 참조하시면 됩니다 bgzip 설치 tabix 설치 그럼 다음에 봐요~ 2017. 3. 14. 이전 1 ··· 8 9 10 11 다음 반응형
