반응형 2017/0414 [VCF] 01. VCF 파일에서 PASS filter 하기 안녕하세요 한주현입니다 생물정보학 코딩 연습과 파일 형식을 익히기 위한 포스팅 첫 번째 시간입니다 오늘은 VCF를 활용한 생물정보학 문제를 포스팅하겠습니다 문항) VCF파일에서 PASS filter하기VCF (Variant Calling Format) 파일은 텍스트 형식의 파일로 meta-information lines, Header, data lines 로 구성되어있습니다 이번 문항에서는 VCF 의 Data Line에서 7번째 컬럼인 FILTER 컬럼에서 PASS로만 찍혀있는 line의 개수를 세어 출력하겠습니다.문항에 해당하는 VCF는 아래의 VCF를 사용하세요. https://raw.githubusercontent.com/KennethJHan/Bioinformatics_smalltalk_Python.. 2017. 4. 3. [공지] 생물정보학 연습문제 카테고리를 시작하며 안녕하세요 한주현 입니다 제가 현재 근무하고 있는 마크로젠에서는 신규 Bioinformatics(생물정보학) 분석부 입사자에 대하여 코딩테스트를 진행하고 있습니다. 2015년 11월 20일 처음 마크로젠에서 코딩테스트 면접을 맡게 된 이래로 현재까지 마크로젠에서 코딩테스트를 진행하고 있습니다. Bioinformatics 의 융복합적인 직업 특성 상 여러 전공자들의 지원이 있습니다만, 대부분 생명과학과 또는 컴퓨터공학 전공자들이 우리 회사의 문을 두드리고 있습니다. 생명과학과 전공자들이 기존 wet-lab에서 시야를 넓혀 컴퓨터 분석을 하는 dry-lab으로 관심을 가지고 학습하는 것은 매우 고무적인 일이라 생각합니다. 생물정보학의 열기를 느낄 수 있었던 일례로, 저는 판교의 바이오협회에서 진행하고 있는 .. 2017. 4. 3. 이전 1 2 3 4 다음 반응형
