반응형 전체 글244 [근황] 생물정보학자의 2019년을 돌아보며 2020년을 향해! 여러분 안녕하세요, 한주현입니다. 잘 지내셨나요? 벌써! 2020년의 한 달이 흘러 내일이면 2020년 2월입니다 ^^; 연말연시인 2019년과 2020년 1월을 돌아보니 많은 일들이 있었네요. 이번 글은 2019년을 돌아보고, 2020년 새해의 다짐에 대해 적어보겠습니다. 목차 2019년에 한 일들 2020년 새해의 다짐 1. 2019년에 한 일들 2019년에 한 일들을 정리해보면.. 1) 결혼 2019년에 한 일중 가장 큰 일은 2019년 2월에 결혼한 것입니다. 이제 곧 1년이 되어가는군요. 2) "바이오파이썬으로 만나는 생물정보학" 도서 출간 저의 첫 도서인 "바이오파이썬으로 만나는 생물정보학" (비제이퍼블릭)을 출간하였습니다. 인기있는 파이썬으로 사용할 수 있는 생물정보학 라이브러리인 바이오파이.. 2020. 1. 31. AI를 활용 게놈 연구 이야기 - 나고야 출장 안녕하세요 한주현입니다. 어느새 2019년의 마지막 달인 12월이 되었습니다. 11월의 끝자락과 12월 초인 지금 저는 업무상 출장으로 名古屋 나고야에 왔습니다. 미팅 일정을 마치고 개인 시간을 활용하여 나고야 역에서 가까운 ジュンク堂書店 준쿠도 서점에 왔습니다. 여러가지 책들 중 눈길을 끈 것은 다름아닌 機械学習、深層学習 기계학습, 딥러닝 이었습니다. 요새 가장 뜨거운 분야인 머신러닝, 딥러닝 분야에서 제가 몸담고 있는 의료의 적용은 x-ray나 MRI 이미지 또는 병리 슬라이드를 필두로 게놈 분야에 까지 이르게 되었습니다. 몇 권의 책을 구매하였는데 그 중 実験医学 실험의학 2019.10월 호에는 "AI와 암연구 그 타당성의 유효성” 의 주제로 특집 기사를 냈습니다. 특히 게놈에 대한 AI연구를 소개.. 2019. 12. 1. [논문] 딥러닝으로 환자의 예후 예측하기 - 악성 중피종 시작하며 안녕하세요, 한주현입니다. 오늘은 딥러닝으로 환자 예후를 예측한 논문을 소개해보겠습니다. 이번 논문은 2019년 10월인 이번달 7일에 Nature Medicine에 발표된 논문으로, 딥러닝 기반 분류를 사용하여 악성 중피종 (MM, Malignant Mesothelioma)의 예후를 예측률을 높였습니다. 목차 악성 중피종 MesoNet - 딥러닝 기반 악성 중피종 예후 분류 악성 중피종 (MM, Malignant Mesothelioma) 논문을 소개하기 앞서 악성 중피종에 대해 알아보겠습니다. 중피종은 중피(mesothelium)에 생기는 종양으로, 중피는 중배엽의 편평세포 층으로 복막, 심막, 흉막 등의 표면에 위치합니다. 악성 중피종은 80%의 경우가 석면(asbestos)의 노출과 연관이.. 2019. 10. 13. BED 파일을 ucsc genome browser에 추가하는 방법 시작하며 안녕하세요, 한주현입니다. 오늘은 bed 파일을 ucsc genome browser에 추가하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 목차 bed 파일 준비하기 genome browser에 넣기 bed 파일 준비하기 다음 예시 링크에 들어가 bed 파일을 다운받습니다. https://github.com/KennethJHan/Genome-Analysis-Tutorial/blob/master/result/kit.pad.sort.merge.bed genome browser에 넣기 1) http://genome.ucsc.edu 에 접속하여 Genomes의 Human GRCh37/hg19 을 클릭한다. 2) 다음 화면의 아래에 add custom tracks 버튼을 클릭한다. 3) Choose File 버튼을 누른.. 2019. 10. 6. 이전 1 ··· 7 8 9 10 11 12 13 ··· 61 다음 반응형
