반응형 생물정보학90 [생물정보학 특허] VCF 파일 활용 :: 유전자 서열 변이 정보를 활용한 혈연 관계 판단 방법 :: 특허 등록 후기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 VCF 파일을 사용하여 "유전자 서열 변이 정보를 활용한 혈연관계 판단 방법" 특허를 진행했던 내용과 특허 내용에 대해 작성해보겠습니다. 목차 - 특허를 등록하면서 - 유전자 서열 변이 정보를 활용한 혈연관계 판단 방법 - 간단한 수학 얘기 :: 좌표와 코사인 유사도 - VCF 파일에 담긴 변이들 :: Bag of Variants (BOV) - 마치며 - 특허를 등록하면서 현재 저는 희귀질환 유전 질환 변이들을 해석하여 희귀질환자들의 진단에 큰 기여를 하고 있는 쓰리빌리언에 다니고 있습니다. 포스팅을 쓰는 현 시점에서 벌써 3년하고도 2개월 정도의 시간이 흐르고 있네요. 쓰리빌리언에 다니면서 변이 해석 알고리즘 그 동안 여기에서 총 두 개의 특허를 작성했었습니다. 금번 포.. 2022. 5. 22. [번역서 출간] 생물정보학 알고리듬 3rd edition, 번역 후기 안녕하세요 한주현입니다 2021년이 시작함과 함께 도서 번역을 하나 마무리하여 출간되었음을 말씀드립니다~ 도서는 아래와 같습니다 http://www.yes24.com/Product/Goods/106541013 생물정보학 알고리듬 3/e - YES24 과학 기술의 발달로 인류는 유전체의 정보를 염기서열 단위까지 좁혀서 생명체의 비밀을 밝혀내고 있다. 생명체에서 나오고 있는 데이터는 인류 역사상 가장 큰 규모의 데이터 크기를 자랑하고 www.yes24.com 본 도서는 총 11장으로 구성되었으며, 각 챕터마다 생물정보학적인 에피소드들을 소개하며 중간 중간 알고리즘을 의사코드 (pseudo-code)로 제시하여 파이썬 뿐만 아니라 C++, JAVA, perl 등 독자들이 원하는 언어로 알고리즘을 배울 수 있다.. 2022. 3. 1. 생물정보학 서버 사양 - 클라우드 vs. 온프레미스 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 생물정보학에서 사용하는 적당한 규모의 서버에 대해 포스팅해보겠습니다. 목차 - 들어가며 - 생물정보학에서 사용하는 서버 - 클라우드 vs. 온프레미스 - 클라우드와 온프레미스 가격 비교 - 클라우드 컴퓨팅을 사용해야 할 때 - 온프레미스를 사용해야 할 때 - 생물정보학에서 사용하는 (적당한) 사양의 서버 추천 - 서버실과 서버의 생김새 - 마치며 들어가며 생물정보학이란 학문은 (대부분) 필연적으로 큰 사이즈의 데이터들을 다루게 되고, 큰 사이즈의 데이터들은 일반 PC나 노트북에서 분석하기가 어렵기 때문에 CPU의 성능이 좋고 RAM도 꽤나 큰 서버를 사용하게 됩니다. 생물정보학 연구를 하시는 여러분들이 굳이 하드웨어적인 부분을 아실 필요는 없지만,, 내가 분석하는 데이터가.. 2022. 1. 25. 2022년 새해 복 많이 받으세요 - 새해 목표 안녕하세요 한주현입니다. 2022년 새해가 밝았습니다. 블로그에 방문해주신 여러분들 새해 복 많이 받으세요~! 2022년은 저에게 특별한 해 입니다. 하나씩 적어볼게요. 1. 쓰리빌리언에 다닌지 만 3년이 되는 해 이전 직장인 마크로젠에서 2015-2019년 (3년6개월) 데이터분석부에서 근무하고 쓰리빌리언으로 이직하여 bioinformatics engineer로 일한지 벌써 만 3년이 다 되어갑니다. 10명 남짓 되었을때 합류를 하였는데 현재는 50명이 훌쩍 넘었습니다. 사람도 많이 늘었고 장비 (서버 들, 실험실 장비들) 가 상당히 많이 늘어서 테헤란로의 사무실이 꽉찼습니다. 이래저래 사람이 많아도 다들 화목하고 일에는 치열하게 근무하고 있습니다. 쓰리빌리언에 생명정보학 엔지니어로 근무하면서 생명정보.. 2022. 1. 18. 이전 1 2 3 4 5 ··· 23 다음 반응형
