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2018/058

[뱀뱀이 프로그래밍 만화] C# hello world 안녕하세요 한주현 입니다 :) 오늘은 C#의 Hello World 를 그려보았습니다 ㅎㅎ C# 의 Hello world 123456789using System; namespace HelloWorld { class Hello { static void Main() { Console.WriteLine("Hello World!"); } }}Colored by Color Scriptercs 2018. 5. 22.
[뱀뱀이 프로그래밍 만화] JAVA hello world 안녕하세요 한주현 입니다 :) 앞으로 뱀뱀이 프로그래밍 만화를 업로드 해보려 합니다 ㅎㅎ 끄적거리는 실력밖에 안되지만 ㅜㅜ 재미로 봐주세요 ㅎㅎ JAVA의 Hello world 12345class Hello { public static void main(String[] args) { System.out.println("Hello World!"); }}Colored by Color Scriptercs 2018. 5. 22.
[바이오파이썬] 4.3.1 SeqFeature 객체 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 Biopython에서 SeqFeature 객체에 대하여 알아보겠습니다. 바이오파이썬에서 새로 로고가 나왔더군요 ㅎㅎ 참 예쁘게 잘 만드신 것 같습니다 ㅎㅎㅎ 목표 이전 포스팅에서 FASTA, GenBank 파일로 부터 SeqRecord 객체를 만드는 방법에 대해 배워봤습니다. http://korbillgates.tistory.com/89 오늘은 SeqRecord 의 정보를 담고 있는 SeqFeature 객체에 대해 알아보려 합니다. 준비물 실습에 사용할 파일입니다 ㅎㅎ https://raw.githubusercontent.com/biopython/biopython/master/Tests/GenBank/NC_005816.gb 다운 받아 주세요 ㅎㅎ SeqFeature 객체 .. 2018. 5. 22.
[GATK] DepthOfCoverage 란? Depth of coverage의 soft clip 처리. Depth of coverage 분석 방법 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 GATK의 툴 중 하나인 DepthOfCoverage 에 대해 알아보고, Soft Clip을 처리하는 방식과 DepthOfCoverage 의 command line에 대해 알아보겠습니다. Depth Of Coverage 란? DepthOfCoverage 는 GATK 의 Tool 중의 하나로, 말 그대로 Coverage의 Depth를 계산해줍니다. 아래 그림은 Reference genome에 mapping 된 read들을 표현한 그림입니다. 100bp 가 되는 12개의 read들이 reference sequence에 맞게 mapping 된것인데요, 왼쪽의 covered region의 길이가 350bp라고 해봅시다. mapping된 read는 총 1,200bp 이며, 계산식에.. 2018. 5. 16.
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