VCF 파일의 indexing 하기

안녕하세요

한주현입니다

오늘은 VCF 파일의 indexing 방법에 대하여 알아보고자 합니다

VCF파일에 대한 간단한 설명은 아래 링크를 참조해 주세요

https://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf

# Command Line

$ bgzip -c sample.vcf > sample.vcf.gz

$ tabix -p vcf sample.vcf.gz

# Result

sample.vcf.gz.tbi

bgzip 또는 tabix 의 설치에 관한 링크는 다음을 참조하시면 됩니다

bgzip 설치

tabix 설치

그럼 다음에 봐요~