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바이오파이썬15

[근황] 2019년 5월 한주현의 근황 안녕하세요 한주현입니다. 여러분 잘 지내셨는지요? 오래간만에 근황보고를 드립니다. 올해는 시작부터 개인적으로 많은 일들이 있었습니다. 2019년 2월 서울 송파구로 이사함 결혼함 2019년 3월 "바이오파이썬으로 만나는 생물정보학" BJ퍼블릭 출판사 - 도서 출간 정들었던 마크로젠을 떠남 ㅜㅜ.. 2019년 4월 금창원 대표님이 계신 3billion 에 Bioinformatics Engineer 포지션으로 join 2019년 9월 (예정) 서울대학교 의료정보학 협동과정 시작 근황 QnA Q. 정들었던 마크로젠 데이터분석부에서 3billion의 Bioinformatics Engineer로 join하게 된 가장 큰 계기가 무엇인가요? A. 개인적으로 조금 더 많은 성장 기회를 보고 싶었기 때문이었습니다. 간.. 2019. 5. 17.
[도서] 바이오파이썬으로 만나는 생물정보학 독자 여러분 안녕하세요 한주현입니다. 제가 도서를 한 권 출판하였습니다 ! 오늘은 바이오파이썬으로 만나는 생물정보학에 대해서 이야기 나눠보겠습니다!! 출판사 소개 링크https://bjpublic.tistory.com/324 파이썬 사전으로 소개 ㅎㅎ 123456789101112131415161718192021222324252627282930313233basic_info = { "제목(subject)" : "바이오파이썬으로 만나는 생물정보학", "저자(author)" : "한주현", "페이지(page)" : "312", "출간일(publish date)" : "2019년 3월 22일" } reader = { 1 : "바이오파이썬으로 생물정보학을 배우고 싶은 의생명연구자", 2 : "파이썬으로 생물정보학 .. 2019. 3. 12.
[바이오파이썬] 5.1.1 SeqIO 모듈로 서열 파일 읽기 - FASTA 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 SeqIO 로 파일읽는 방법에 대해 알아보겠습니다. SeqIO로는 FASTA, FASTQ, GenBank 등의 파일을 읽을 수 있는데 오늘은 SeqIO의 메서드와 FASTA 파일 읽기를 살펴보겠습니다. 목표 SeqIO 모듈의 Sequence 파일을 읽는 두 가지 메서드인 SeqIO.read(), SeqIO.parse()에 대해 알아보겠습니다. SeqIO 모듈을 활용하여 FASTA 파일을 읽는 방법에 대해 알아보겠습니다. 준비물 오늘은 준비물이 없습니다 ㅎㅎ 예시 파일은 우리가 그냥 메모장으로 만들어봐요~ SeqIO의 두 가지 메서드 SeqIO 모듈을 가지고 Sequence 파일을 읽을 때 두 가지 메서드가 있습니다. SeqIO.read() SeqIO.parse() 간단히 .. 2018. 12. 24.
[바이오파이썬] 4.4 SeqRecord 비교 - NotImplemented 오류 - 파이썬 객체간의 비교 __eq__ 의 의미 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 SeqRecord 객체 간의 비교에 대해 알아보겠습니다. 목표 이전 포스팅까지 SeqFeature 객체에 대해 배워봤습니다. http://korbillgates.tistory.com/141http://korbillgates.tistory.com/144 오늘은 SeqRecord 객체 간의 비교하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 그리고 그냥 끝내면 아쉬우니!! ㅋㅋ __eq__ 에 대해서도 알아볼까요? 준비물 오늘은 준비물이 없습니다 ㅎㅎ 그냥 biopython을 실행해주세요 ㅎㅎ SeqRecord 객체 비교 Seq 객체에 id 를 넣어서 SeqRecord 객체를 만들어 보겠습니다. 서열은 그냥 아무거나 넣어보죠 ㅎㅎ "ACGT" 로 해 볼까요? 123456from Bio.Se.. 2018. 5. 26.
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