반응형 분류 전체245 samtools 설치하기 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 samtools 설치에 대하여 알아보겠습니다 참조 URL http://www.htslib.org/doc/samtools.html http://www.htslib.org/download/ 다음 URL에 들어가시거나 http://www.htslib.org/download/ 또는 제가 아래에 준비한 링크를 직접 받으셔도 됩니다 다운로드 링크 https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.3.1/samtools-1.3.1.tar.bz2 이제 본격적으로 설치해보죠.. 1) 압축해제$ tar xf samtools-1.3.1.tar.bz2 2) 설치$ make$ make prefix=경로지정 install 설치과정 Makefile:.. 2017. 3. 14. bcftools 설치하기 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 bcftools 설치에 대하여 알아보겠습니다 참조 URL http://www.htslib.org/doc/bcftools.html http://www.htslib.org/download/ 다음 URL에 들어가시거나 http://www.htslib.org/download/ 또는 제가 아래에 준비한 링크를 직접 받으셔도 됩니다 다운로드 링크 https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.3.1/bcftools-1.3.1.tar.bz2 이제 본격적으로 설치해보죠.. 1) 압축해제$ tar xf bcftools-1.3.1.tar.bz2 2) 설치$ make$ make prefix=경로지정 install 설치과정 cd htslib.. 2017. 3. 14. VCF 파일의 indexing 하기 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 VCF 파일의 indexing 방법에 대하여 알아보고자 합니다 VCF파일에 대한 간단한 설명은 아래 링크를 참조해 주세요 https://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf # Command Line $ bgzip -c sample.vcf > sample.vcf.gz $ tabix -p vcf sample.vcf.gz # Resultsample.vcf.gz.tbi bgzip 또는 tabix 의 설치에 관한 링크는 다음을 참조하시면 됩니다 bgzip 설치 tabix 설치 그럼 다음에 봐요~ 2017. 3. 14. 근황 보고 안녕하세요 마크로젠 한주현 입니다작년 시작했던 블로그를 여러 신변의 변화로 인해 잠시 뜸 했었습니다 ㅠㅠ..만 오늘부터 착실히 시작하려 합니다 ㅎㅎ 과거 블로그를 시작할 때 쯤은 학교를 다녔습니다만, 현재 저는 마크로젠 데이터분석부에서 근무하고있습니다 지금까지 배워왔던 그리고 새로운 뉴스들 업데이트하며 블로그를 정리하고자 합니다 ㅎㅎ딱히 아래에서 부터 위로 올라가는 방식의 글이 아닌, 특정 프로젝트별로 정리 할 계획입니다 그럼 다음 글에서 봐요~ - 끝 2017. 3. 14. 이전 1 ··· 48 49 50 51 52 53 54 ··· 62 다음 반응형
