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컴퓨터106

[cpp] FASTA 파일을 인덱스를 사용하여 읽는 방법 들어가며안녕하세요 한주현입니다 오늘은 cpp로 fasta 파일을 읽는데 index를 사용하여 전체 파일을 읽지 않고,미리 인덱스 파일을 읽어 해당 위치로 이동하여 읽을 수 있는 코드에 대해 말해보겠습니다. FASTA 파일 설명먼저 FASTA 파일과 FASTA 파일의 index 파일에 대해서 설명해보겠습니다.FASTA 파일은 아래와 같이 생겼습니다. > 로 시작하는 header 줄이 있고 그 다음은 염기서열이 있는 줄 들이 있습니다.각각의 >header 와 서열들을 하나의 record라고 부릅니다.FASTA 파일에는 하나의 record가 들어있을 수도 있고 여러개의 records가 있을 수도 있습니다.예시에서는 세 개의 records가 있고 각각의 record는 한 줄의 염기 개수가 60자로 되어있습니다... 2024. 6. 20.
Amazon Linux에서 Java Java8 설치하는 방법 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 AWS EC2에서 Amazon Linux 2 또는 Amazon Linux 2023에서 Java, Java8 를 설치하는 방법에 대해 포스팅해보겠습니다. 문제상황 기본적으로 Amazon Linux 2023 AMI로 EC2 인스턴스를 생성하면 Java가 설치되어있지 않습니다. 아래와 같이 which java 명령어를 수행하여도 결과가 없거나, ls 커맨드로도 java가 없는 경우 Java가 서버에 설치 되어있지 않은 경우입니다. $ which java $ ls /usr/bin/java ls: cannot access '/usr/bin/java': No such file or directory 가장 쉽게 설치 할 수 있는 방법은 yum 으로 설치하는 방법입니다. yum list에.. 2024. 3. 4.
[C++] google test 실제 코드에서 컴파일 및 수행 방법 실제 코드에 적용 목차 google test 설치 방법 google test 수행 방법, ASSERT와 EXPECT google test 다양한 ASSERT, EXPECT 테스트 방법 google test 실제 코드에서 컴파일 및 수행 방법 (본 글) 들어가며 지금까지는 gtest를 설치하고 ASSERT, EXPECT의 다양한 macro들을 알아보았습니다. 이번 포스팅에서는 소스코드와 헤더파일 그리고 테스트 코드 파일이 분리된 환경에서 gtest를 수행하는 방법에 대해서 알아보겠습니다. code design 04.factorial.cpp : factorial 를 계산해주는 함수가 있는 소스코드 04.factorial.h : factorial.cpp 의 header 파일 04.factorial_main.c.. 2023. 9. 3.
[C++] google test 다양한 ASSERT, EXPECT 테스트 방법 Assert와 Expect 목차 google test 설치 방법 google test 수행 방법, ASSERT와 EXPECT google test 다양한 ASSERT, EXPECT 테스트 방법 (본 글) google test 실제 코드에서 컴파일 및 수행 방법 들어가며 지난 포스팅에서는 첫 번째 google test code를 작성해보았습니다. 그리고 간단하게 ASSERT와 EXPECT에 대해서도 알아보았습니다. 이번 포스팅에서는 ASSERT와 EXPECT에 대해 더 자세히 알아보도록 하겠습니다. ASSERT와 EXPECT에서 사용할 수 있는 macro 들 EXPECT_TRUE(condition): 조건이 참인지 테스트 EXPECT_FALSE(condition): 조건이 거짓인지 테스트 EXPECT_EQ.. 2023. 9. 3.
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