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생물정보학90

VCF GT, DP, AD와 genotype 0/0 , 0/1 , 1/1의 의미 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 VCF 파일의 GT, DP, AD와 Genotype에서 0/0, 0/1, 1/1 의 의미에 대해 알아보겠습니다. 목차 VCF 파일의 관찰 GT, AD, DP의 의미 Genotype 에서의 0/0, 0/1, 1/1 의 의미 그럼 genotype 언제 쓰나요? VCF 파일의 관찰과 GT, AD, DP의 의미 VCF 파일을 보시면 1 2 3 4 #CHROM POS ID REF ALT [중간 삭제] FORMAT Sample1 Sample2 chr21 18269600 rs12345 T TGCG [중간 삭제] GT:AD:DP 0/1:44,37:81 0/0:0,90:90 chr21 18269704 . A C [중간 삭제] GT:AD:DP 0/1:720,910:1630 1/1:2,401.. 2019. 7. 15.
[github] github 파일 다운로드 방법 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 github에 있는 파일을 다운 받는 방법에 대해 알아보겠습니다. 들어가며 제가 출판한 "바이오파이썬으로 만나는 생물정보학" 도서 뿐만 아니라 요새 출판되는 여러 도서 및 소스코드 공유는 github로 많이 제공되고 있습니다. 간간히 저에게 자료를 어떻게 받는지 방법에 대해 문의하시는 분들이 계셔서 오늘은 github에서 자료를 받는 세 가지 방법에 대해 알아보겠습니다. 1. 그냥 사이트에 들어가서 하나씩 받기 다음 주소에 있는 파일인 blastSample.fasta 파일을 하나 받아보겠습니다. https://github.com/KennethJHan/Bioinformatics_Biopython/blob/master/Section1/Chap1/blastSample.fasta.. 2019. 5. 27.
[교육] 포스트게놈다부처유전체사업 유전체 분석 예비전문가 과정 (7기) 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 한국바이오협회에서 진행하는 포스트게놈다부처유전체사업 유전체 분석 예비전문가 과정(7기) 교육과정을 소개해보고자 합니다. 생물정보학 필드에 있고 블로그를 운영하다 보니 자주 듣게되는 질문 중 하나가 생물정보학 관련하여 교육을 듣고 싶은데 어떤 교육이 있나요? 또는 괜찮은 교육이 있나요? 등 이 있습니다. 리눅스, 파이썬 프로그래밍, NGS 데이터분석, 기업 방문 및 인턴십 등의 알찬 프로그램이 제공됩니다! "유전체 분석 예비전문가 과정" 교육은 현재 7기째 진행되는 교육으로 1~6기 교육 수료생들은 이 교육에서 배운 지식을 바탕으로 현재 각 유전체 분석 업계에 취업하셔서 많은 활동을 하고 계십니다. 아.. 그리고 제가 여기서 파이썬 분석 프로그래밍 강의의 강사로 참여합니다 .. 2019. 5. 17.
[도서] 바이오파이썬으로 만나는 생물정보학 독자 여러분 안녕하세요 한주현입니다. 제가 도서를 한 권 출판하였습니다 ! 오늘은 바이오파이썬으로 만나는 생물정보학에 대해서 이야기 나눠보겠습니다!! 출판사 소개 링크https://bjpublic.tistory.com/324 파이썬 사전으로 소개 ㅎㅎ 123456789101112131415161718192021222324252627282930313233basic_info = { "제목(subject)" : "바이오파이썬으로 만나는 생물정보학", "저자(author)" : "한주현", "페이지(page)" : "312", "출간일(publish date)" : "2019년 3월 22일" } reader = { 1 : "바이오파이썬으로 생물정보학을 배우고 싶은 의생명연구자", 2 : "파이썬으로 생물정보학 .. 2019. 3. 12.
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