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[minimap2] minimap2 설치 및 수행 방법 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 Heng Li 의 새로운 mapping tool 인 minimap2 의 설치 및 수행 방법에 대해 작성해 보겠습니다. 목차 1. minimap2 다운로드2. minimap2 설치3. minimap2 수행 1. minimap2 다운로드 1) 사이트에 접속합니다https://github.com/lh3/minimap2 2) 자료 다운로드 저는 git clone 으로 자료를 다운받았습니다. 사이트에서 빨간색으로 네모 친 부분을 눌러 git 주소를 복사 합니다. 터미널에서 git clone 명령어로 다운 받습니다. 1$ git clone https://github.com/lh3/minimap2.git 2. minimap2 설치 1) 다운 받은 minimap2 디렉터리에 들어갑니다... 2018. 11. 18.
[한주현의 Genome mining] 세계 10대 시퀀싱 회사 순위 안녕하세요. 한주현입니다. 오늘은 세계 10대 시퀀싱 회사 순위에 대해 알아보겠습니다. 목차 1. 폭발적인 성장세를 보이는 NGS(Next-Generation Sequencing) 시장 2. 세계 10대 Sequencing 회사 1. 폭발적인 성장세를 보이는 NGS(Next-Generation Sequencing) 시장 美 마케팅 조사업체 MarketsAndMarkets에 의하면, 2018년 현재 57억 달러 (한화 약 6조4500억원) 규모의 NGS (Next-Generation Sequencing, 차세대 염기서열분석) 시장이 163.5억 달러(한화 약 18조 5천억원) 규모로 성장할것으로 내다봤다. [1] NGS 시장의 주요 서비스 항목은 1) 샘플을 시퀀싱 기계에 넣기 전 샘플을 준비를 하는 과정.. 2018. 11. 18.
[맥] 맥 단축키 vs 윈도우 단축키 비교 - 맥 터미널 단축키 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 맥 단축키와 윈도우 단축키를 비교하고 맥 터미널에서 사용하는 유용한 단축키들에 대해 알아보겠습니다. 목차 0. 들어가며1. 맥 단축키 vs. 윈도우 단축키 비교2. 맥 터미널 단축키 0. 들어가며 저는 2014년 부터 맥을 사용한 앱등이로, 현재 맥북프로 레티나 13인치 Mid 2014를 사용하고 있습니다. 맥을 맨 처음 사용할 당시는 커맨드 키가 신기했습니다. 커맨드 키는 ⌘ 이렇게 생겼습니다. 커맨드키는 윈도우키 같으면서도 단축키들과 연관이 많습니다. 당장 복붙! 이라고 말하는 복사 붙여넣기의 경우 Command - C : 복사Command - V : 붙여넣기Command - X : 잘라내기 입니다 ㅎㅎ.. 그래서 우선은!! 본격적으로 들어가기에 앞서!! 간편하게!! .. 2018. 11. 18.
[Tool] gnomAD 란? gnomAD vcf 다운로드 방법 및 압축 푸는 방법- gnomAD 활용 방법 - gnomad vcf bgz: unknown suffix -- ignored 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 gnomAD vcf 다운로드 방법과 압축 푸는 방법에 대해 알아보겠습니다. 목차 0. gnomAD 란?1. gnomAD vcf 다운로드 방법2. gnomAD vcf 압축 푸는 방법3. gnomAD 특징 및 활용 0. gnomAD 란? gnomAD (The Genome Aggregation Database) 는 다량의 exome 과 whole genome 시퀀싱 프로젝트를 통해 데이터를 모은 것으로 데이터셋에는 125,748개의 exome과 15,708개의 whole genome 데이터가 있습니다. gnomAD 이전에 exome 데이터로만 데이터베이스를 낸 적이 있는데 ExAC(Exome Aggregation Consortium) 로 알려져있습니다. 다음 그래프를 보시면 얼.. 2018. 11. 17.
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