본문 바로가기
반응형

전체 글245

[리눅스] 병렬처리를 활용한 한번에 여러 파일 tar.gz 압축 푸는 방법 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 멀티코어 CPU를 활용하여 병렬처리를 통한 한 번에 여러 파일의 tar.gz 압축을 푸는 방법에 대해 알아보겠습니다. tar.gz 단일 파일 압축 해제 방법 우선 간단하게 몸풀기로 tar.gz 압축 해제 방법에 대해 알아보겠습니다. 1$ tar xf file.tar.gz 간단하네요 ㅎㅎ tar.gz 여러 파일 압축 해제 방법 이번에는 CPU의 멀티 코어를 활용하여 병렬처리를 통한 여러개 파일 압축 푸는 방법에 대해 알아보겠습니다. 1$ find . -type f -name "*.tar.gz" | xargs -I {} -P 4 tar -xf {} -P 옵션의 값이 4로 되어있는데 이는 한 번에 4개의 프로세스를 진행한다는 얘기 입니다. CPU 연산 능력에 따라 더 높이거나 .. 2018. 12. 9.
[맥] 파일 사이즈를 특정 크기 이상으로 찾고 정렬하는 방법 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 맥북의 파일을 특정 파일 크기 이상 가진 파일을 찾는 방법에 대해 알아보겠습니다. 파일의 특정 크기 이상 파일들 찾기 1) 새로운 파인더를 하나 켭니다. 가장 최근 액세스한 파일들이 나오네요. 구질구질 많습니다 ㅎㅎ; 2) command + shift + H 키를 눌러서 홈으로 이동합니다. 3) Kind를 File Size로 바꾸고 Any를 is greater than 으로 바꾸고 원하시는 파일 사이즈를 입력합니다. 저는 2GB 이상인 파일들을 정렬해보려고 합니다. 이렇게 입력해 주면 바로 짠! 하고 큰 파일들이 나옵니다 ㅎㅎ 생물정보학 파일들과 안드로이드 가상머신 파일이 나오네요 ^^;; 쟤네들 때문에 용량이 없네요 ㅜㅜ 아이고.. 오늘은 맥에서 파일 크기대로 써보았습니.. 2018. 12. 8.
[Tool] BLAST 리눅스 로컬 설치 및 실행방법 - BLAST LINUX local install and execute - BLAST 로컬 설치의 장단점 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 BLAST를 로컬에 설치하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 목차 1. BLAST 로컬 설치의 장단점 2. BLAST 로컬 설치 및 실행 1. BLAST 로컬 설치의 장단점 BLAST는 NCBI에서 제공하는 툴로 서열을 넣어주면 데이터베이스와 비교하여 서열에 대해 종을 찾아주는 아주아주 유용한 툴입니다. 일반적으로 우리는 BLAST를 NCBI에서 제공하는 페이지, 즉 웹에서 접근해서 사용하는데요 이런 페이지입니다 ㅎㅎ.. 웹에서 하면 편하긴 한데.. 연구나 분석을 하다보면 GUI환경이 아닌 터미널 CLI 환경에서 진행해야 할 경우가 많습니다. 왜냐하면 웹에서 하나씩 서열을 붙여넣어서 할 수도 있지만, 10,000개나 되는 서열을 BLAST 해야 한다면 10,000번 동안 하고.. 2018. 12. 8.
[근황] 서울여대 생물정보학 강의 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 저의 근황에 대해서 얘기해보겠씁니다 ㅎㅎ 근황 1. 추운 날씨와 뱅쇼 2. 서울여대 생물정보학 강의 1. 추운 날씨와 뱅쇼 날이 상당히 춥습니다 ㅜㅜ 재난 안전 앱에서 조심하라고 알람이 올정도군요 ㅜㅜ 추운날에는 역시.. 뱅쇼입니다. (무알콜) 투썸플레이스에서 파는 뱅쇼인데 여러 재료가 많이 들어있습니다 ㅎㅎ 맛있네요 :) 2. 서울여대 생물정보학 강의 2018년 12월 초, 서울여대 김명겸 교수님의 초청으로 학생분들께 생물정보학에 대해 실무에서 진행하는 분석 파이프라인에 대해 강의를 진행하였습니다. 자세한 강의 내용은 다음 URL로 갈음합니다. https://kennethjhan.github.io/Genome-Analysis-Tutorial/ 실무에서 사용하는 분석 파이.. 2018. 12. 8.
반응형

티스토리툴바