반응형 Variant1 [GATK] UnifiedGenotyper vs. HaplotypeCaller 차이점 - 무엇을 써야 할까요? 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 GATK의 tool 종류 중 variant calling tool인 UnifiedGenotyper 와 HaplotypeCaller 의 차이점에 대해서 알아보겠습니다 최근에 아는 동생이 GATK의 UnifiedGenotyper가 GATK4 버전에서 없어졌다고 하여 그 이유에 대해서 물어왔습니다 ㅎㅎ; 일반적으로 실무에서는 GATK Best Practice 를 기반으로 만든 분석 파이프라인을 사용하는데 variant calling tool로는 UnifiedGenotyper가 아닌 HaplotypeCaller 를 사용하고 있습니다. HaplotypeCaller는 UnifiedGenotyper보다 나중에 개발된 최신 tool로 SNP와 Indel을 동시에 calling 해줍니다... 2018. 3. 3. 이전 1 다음 반응형
