반응형 BAM6 [samtools] BAM 파일을 FASTA, FASTQ 파일 형식으로 변환하기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 samtools로 BAM파일의 정보를 가지고 FASTA, FASTQ 파일 형식으로 바꾸는 방법 에 대하여 알아보겠습니다. samtools samtools 로 BAM 파일에서 FASTA, FASTQ 파일형식으로 변환 - 준비물 준비물1) samtoolssamtools 설치가 되어 있지 않다면 다음 링크들을 참고해 주세요 - samtools 공식 다운로드 페이지http://www.htslib.org/download/ - samtools 설치 방법http://korbillgates.tistory.com/57 2) 실습 bam 파일http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/wgEncodeUwRepliSeq/wgEncode.. 2017. 11. 22. [samtools] BAM 파일에서 특정 chromosome 영역 추출하기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 samtools로 BAM파일에서 원하는 chromosome 또는 영역을 추출하는 방법 에 대하여 알아보겠습니다. samtools samtools 로 BAM파일에서 원하는 chromosome 또는 영역을 추출하는 방법 - 준비물 준비물1) samtoolssamtools 설치가 되어 있지 않다면 다음 링크들을 참고해 주세요 - samtools 공식 다운로드 페이지http://www.htslib.org/download/ - samtools 설치 방법http://korbillgates.tistory.com/57 2) 실습 bam 파일http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/encodeDCC/wgEncodeUwRepliSeq/wgEncod.. 2017. 11. 22. 이전 1 2 다음 반응형