반응형 강의3 [강연 후기] 덕성여대 WISET 사업단 바이오인포매틱스 교육, 생물정보학 강의 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 지난 7월에 진행한 바이오인포매틱스 교육 후기와 사진 및 강의 자료를 공유해보는 시간을 가져보겠습니다. 들어가며 지난 7월 중순의 주말동안 토, 일, 토, 일의 4일 동안 덕성여대 WISET 사업단에서 마련해준 자리에서 생물정보학 강의를 오프라인+온라인 진행했습니다. 내용은 나름 야심차게.. 준비했었습니다.. ㅋㅋ 1) 현업에서 일하고 있는 인생 선배로 생물정보학에 관심이 있는 꿈나무들에게 해주고 싶은 업계 이야기 2) 기본적인 파이썬 문법 강의 3) "바이오파이썬으로 만나는 생물정보학" 의 내용을 일부 발췌하여 바이오파이썬으로 covid19 서열 다루고, 논문들의 abstract 를 가져오고, weblogo를 만들고 4) AWS 클라우드로 인스턴스 만들고 리눅스 커맨드라.. 2020. 8. 9. [생물정보학 유튜브 강의] 생물정보학 툴 설치 (samtools) 및 bam 파일 보는 방법 안녕하세요 한주현 입니다. 생물정보학 유튜브 강의를 하나 더 제작하였습니다. 오늘은 "생물정보학 리눅스 툴 설치 (samtools) 및 bam 파일 보는 방법" 의 주제로 포스팅해보겠습니다. 생물정보학을 처음 접하고, 리눅스를 처음 접한 생물정보학 꿈나무라면, 리눅스에서 툴 설치는 큰 산으로 다가올 수 있습니다. 동영상 강좌가 도움이 되셨으면 좋겠습니다. 오늘은 생물정보학에 처음 입문하시고 리눅스가 익숙치 않으신 분들을 위해, 생물정보학 툴 중 하나인 samtools를 설치하고 bam 파일을 보는 방법에 대해 유튜브 동영상을 만들어서 업로드 해보았습니다. 유튜브 구독과 좋아요 많이 부탁드릴게요! 그럼 담에 또 만나요~~ 2020. 6. 14. [강의자료] 생물정보학 강의, FASTQ, BAM, VCF, samtools 설치 안녕하세요 한주현입니다. 감사하게도 기회가 되어 2019년부터 서울여대 학생들께 생물정보학을 가르치러 강의를 나가고 있습니다. 강의를 열어주신 김명겸 교수님께 이 자리를 빌어 감사의 말씀드립니다. 강의 주제는 생물정보학 전반에 대한 내용으로 다음과 같은 주제를 다루었습니다. 리눅스 다루기 시퀀싱과 염기서열 분석 리눅스에서 생물정보학 툴 설치 간단한 파이프라인 만들기 (BWA-GATK) github 사용하기 클라우드 컴퓨팅 환경 사용하기 (AWS (Amazon Web Service) 또는 GCP (google cloud platform)) 바이오파이썬 실무에서 있던 에피소드들 등등.. 1년간 여러 주제와 실무 환경을 학부생들의 눈높이에 맞게 강의 했었네요 이번 2020년도 1학기의 경우 코로나19로 인해 .. 2020. 5. 21. 이전 1 다음 반응형
