반응형 multiple sequence alignment2 [생물정보학 유튜브 강의] 코로나 바이러스 covid 19 서열로 웹로고 그려보기 안녕하세요 한주현 입니다. 이번주 생물정보학 유튜브 강의는 코로나 바이러스 covid-19 서열로 웹로고 그려보기 입니다. 과정은 간단합니다 ^^;; 1) NCBI에서 서열을 받고, 전처리를 진행하고 2) MSA (Multiple Sequence Alignment)를 진행하고 3) Weblogo를 그립니다. 이전에 포스팅으로도 남긴적이 있었는데, 이번에는 동영상으로 과정들을 구체적으로 알려드리려고 합니다. https://korbillgates.tistory.com/225 [생물정보학 파이썬] 코로나 바이러스-19 (COVID-19) 서열 분석, WebLogo, Multiple Sequence Alignment, 계통수 시작하며 안녕하세요 한주현입니다 2020년 연초 COVID-19, 코로나바이러스감염증-.. 2020. 6. 21. [생물정보학 파이썬] 코로나 바이러스-19 (COVID-19) 서열 분석, WebLogo, Multiple Sequence Alignment, 계통수 (phylogenetic tree) 그리기 시작하며 안녕하세요 한주현입니다 2020년 연초 COVID-19, 코로나바이러스감염증-19 (이하 코로나 바이러스)로 전세계적으로 많은 확진자들이 나왔고 아직까지도 기세가 멈추지 않는듯 보입니다. 하지만 발달한 과학 기술로 각국의 의료진 및 과학자들은 빠르게 바이러스의 실체를 밝혀내었고 금세 바이러스의 전체 서열이 웹에 공개 되었습니다. 이번 포스팅에서 생물정보학자인 제가 쓸 내용은, 각국에서 시퀀싱한 코로나 바이러스 서열들을 다운받고 WebLogo를 그려서 어떠한 부분이 보존된 서열(conserved sequence)인지, 계통수(phylogenetic tree)를 그려 각 서열간의 유사도를 살펴보는 시간을 가져보겠습니다. 다음 그림을 만들어 보는게 이번 포스팅의 목표입니다. 분석의 진행은 사용하기 편.. 2020. 3. 1. 이전 1 다음 반응형
