반응형 UCSC2 BED 파일을 ucsc genome browser에 추가하는 방법 시작하며 안녕하세요, 한주현입니다. 오늘은 bed 파일을 ucsc genome browser에 추가하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 목차 bed 파일 준비하기 genome browser에 넣기 bed 파일 준비하기 다음 예시 링크에 들어가 bed 파일을 다운받습니다. https://github.com/KennethJHan/Genome-Analysis-Tutorial/blob/master/result/kit.pad.sort.merge.bed genome browser에 넣기 1) http://genome.ucsc.edu 에 접속하여 Genomes의 Human GRCh37/hg19 을 클릭한다. 2) 다음 화면의 아래에 add custom tracks 버튼을 클릭한다. 3) Choose File 버튼을 누른.. 2019. 10. 6. UCSC blat 사용법 - command line blat stand alone 사용법 안녕하세요 한주현 입니다 오늘은 UCSC BLAT과 사용법에 대해 알아보겠습니다. BLAT 이란? blat은 BLAST-like alignment tool로 UCSC에서 개발한 pairwise sequence alignment tool 입니다 DNA, RNA 또는 Protein sequence를 입력하고 실행을 하게 되면 입력하신 sequence의 위치와 reference sequence와의 match/mismatch를 알려줍니다. 놀라운 점은 사용법이 너무나도 간편하다는 점인데요,간단하게 웹에서 sequence query를 넣고 submit을 누르시면 바로 나오게 됩니다 ㅎㅎ만약 보고싶은 서열의 개수가 많은 경우 command line에서도 실행 가능하다는 점입니다 웹과 커맨드라인 두 가지 방법에 대해.. 2018. 2. 4. 이전 1 다음 반응형
