반응형 GENBANK3 [바이오파이썬] 4.3.2 SeqFeature 의 position, location 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 SeqFeature 에서 Position 과 Location 에 대하여 알아보겠습니다. 목표 이전 포스팅에서 SeqFeature 객체에 대해 배워봤습니다. http://korbillgates.tistory.com/141 오늘은 SeqFeature에서 위치를 나타내는 position과 location에 대해 알아보겠습니다. 준비물 실습에 사용할 파일입니다 ㅎㅎ https://raw.githubusercontent.com/biopython/biopython/master/Tests/GenBank/NC_005816.gb 다운 받아 주세요 Position과 Location SeqFeature 객체에서 영역을 설명하는 방식에는 두 가지가 있습니다. Position 은 한 지점의 영역.. 2018. 5. 24. [바이오파이썬] 4.3.1 SeqFeature 객체 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 Biopython에서 SeqFeature 객체에 대하여 알아보겠습니다. 바이오파이썬에서 새로 로고가 나왔더군요 ㅎㅎ 참 예쁘게 잘 만드신 것 같습니다 ㅎㅎㅎ 목표 이전 포스팅에서 FASTA, GenBank 파일로 부터 SeqRecord 객체를 만드는 방법에 대해 배워봤습니다. http://korbillgates.tistory.com/89 오늘은 SeqRecord 의 정보를 담고 있는 SeqFeature 객체에 대해 알아보려 합니다. 준비물 실습에 사용할 파일입니다 ㅎㅎ https://raw.githubusercontent.com/biopython/biopython/master/Tests/GenBank/NC_005816.gb 다운 받아 주세요 ㅎㅎ SeqFeature 객체 .. 2018. 5. 22. [바이오파이썬] 4.2 Sequence Record 객체 - FASTA, GenBank 파일로 부터 생성하기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 FASTA, GenBank 파일로 부터 SeqRecord 객체를 만드는 방법에 대해 알아보겠습니다. 바로 이전 포스팅에서 SeqRecord 객체에 대해서 알아보았는데요, http://korbillgates.tistory.com/86 SeqRecord 객체는 서열과 annotation 정보 등등을 포함한 객체입니다. 이전 시간에는 아래와 같이 직접 타이핑을 하여 SeqRecord 객체를 만들었는데요, 1 2 3 4 5 6 from Bio.Seq import Seq from Bio.SeqRecord import SeqRecord simple_seq = Seq("GATC") simple_seq_r = SeqRecord(simple_seq) print(simple_seq_r) c.. 2017. 10. 30. 이전 1 다음 반응형
