[뱀뱀이 프로그래밍 만화] Pileup Read - 생물정보학

 

 

안녕하세요 한주현 입니다 :)

오늘은 생물정보학 포맷 개념 중 하나인 pileup 에 대해서 그려보았습니다.

Pileup

pileup 은 기준이 되는 서열에 sequencer (샘플로 부터 염기서열을 읽는 기계) 에서 나온

Read(리드, sequencer 가 한 번 동안에 읽은 서열)를 잘~ 맞게 붙여서 만든 파일 (sam 또는 bam 파일)에서

쌓아 올라가는 방식으로 read를 표현한 포맷 입니다 ㅎㅎ...

어려운데 말 또한 기네요;; ㅜㅜ

GATK 로 해당 파일을 생성해 낼 수 있습니다.

다음 링크를 참고해 주세요 ㅎㅎ

링크 : http://korbillgates.tistory.com/165

어려운 내용 쉽게 풀어보고자 열심히 그림을 그려보고 있습니다!!

꼭 도움이 되셨으면 좋겠네요 ㅎㅎ

생물정보학 pileup 포맷에 대해 그려보았습니다 ㅎㅎ

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한주현 드림