반응형 SeqRecord3 [바이오파이썬] 4.4 SeqRecord 비교 - NotImplemented 오류 - 파이썬 객체간의 비교 __eq__ 의 의미 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 SeqRecord 객체 간의 비교에 대해 알아보겠습니다. 목표 이전 포스팅까지 SeqFeature 객체에 대해 배워봤습니다. http://korbillgates.tistory.com/141http://korbillgates.tistory.com/144 오늘은 SeqRecord 객체 간의 비교하는 방법에 대해 알아보겠습니다. 그리고 그냥 끝내면 아쉬우니!! ㅋㅋ __eq__ 에 대해서도 알아볼까요? 준비물 오늘은 준비물이 없습니다 ㅎㅎ 그냥 biopython을 실행해주세요 ㅎㅎ SeqRecord 객체 비교 Seq 객체에 id 를 넣어서 SeqRecord 객체를 만들어 보겠습니다. 서열은 그냥 아무거나 넣어보죠 ㅎㅎ "ACGT" 로 해 볼까요? 123456from Bio.Se.. 2018. 5. 26. [바이오파이썬] 4.2 Sequence Record 객체 - FASTA, GenBank 파일로 부터 생성하기 안녕하세요 한주현입니다. 오늘은 FASTA, GenBank 파일로 부터 SeqRecord 객체를 만드는 방법에 대해 알아보겠습니다. 바로 이전 포스팅에서 SeqRecord 객체에 대해서 알아보았는데요, http://korbillgates.tistory.com/86 SeqRecord 객체는 서열과 annotation 정보 등등을 포함한 객체입니다. 이전 시간에는 아래와 같이 직접 타이핑을 하여 SeqRecord 객체를 만들었는데요, 1 2 3 4 5 6 from Bio.Seq import Seq from Bio.SeqRecord import SeqRecord simple_seq = Seq("GATC") simple_seq_r = SeqRecord(simple_seq) print(simple_seq_r) c.. 2017. 10. 30. [바이오파이썬] 4.1. Sequence Record 객체 안녕하세요 한주현 입니다. 오늘은 Sequence Record 객체에 대해 알아보겠습니다. 이전 03. Sequence 객체 단원에서는 문자열 같은 Sequence 객체에 대해서 알아보았는데요, 오늘 말씀드릴 Sequence Record는 서열 뿐만 아니라 여러 정보를 가지고 있는 객체입니다. 4.1 SeqRecord 객체 .seq - Sequence 그 자체 입니다 [Seq 객체] .id - primary ID 로 sequence를 판별할 때 사용하며 대부분의 경우 accession number입니다. [문자열] .name - sequence의 이름으로 accession number와 같을 수도 있습니다. [문자열] .description - 사람이 읽을 수 있는 설명입니다 [문자열] .letter_a.. 2017. 10. 29. 이전 1 다음 반응형
