본문 바로가기
반응형

2017/0310

알록달록한 리눅스 PS1 프롬프트 설정 - Colorful Linux PS1 Setting 안녕하세요 한주현입니다 저는 개인적으로 검은 화면에 칙칙한 회색 글씨만 나오는 터미널이 지루합니다 ㅎㅎ; 그래서 저는 프롬프트 PS1 설정을 바꾸었는데요 아래와 같습니다 색이 알록달록해서 코딩할 맛이 나겠네요 ㅎㅎ 그래서 오늘은 알록달록한 PS1 설정 방법을 말씀드리겠습니다 $ vim ~/.bashrc 로 들어가셔서 아래의 내용을 추가해줍니다 ### PS1 Configuration ### BLACK=$(tput setaf 0) RED=$(tput setaf 1) GREEN=$(tput setaf 2) LIME_YELLOW=$(tput setaf 190) YELLOW=$(tput setaf 3) POWDER_BLUE=$(tput setaf 153) BLUE=$(tput setaf 4) MAGENTA=$(t.. 2017. 3. 31.
SnpEff 사용방법1 - 다운로드 및 설치, vcf annotation 안녕하세요 한주현 입니다 오늘은 snpEff 를 간략히 소개해 드리고,다운로드 및 설치, vcf annotation 까지 진행해보고자 합니다 목차 1. SnpEff 소개 1.1 시스템 사양 1.2 라이센스 2. SnpEff 다운로드3. SnpEff 설치4. SnpEff 를 사용한 vcf annotation 4.1 데이터베이스 받기 4.2 커맨드라인5. 마치며 1. SnpEff 소개 SnpEff 는 annotation tool로 variant를 annotation 하고 아미노산 change 와 같은 genetic effect를 예측하여 정보를 붙여주는 tool 입니다.사용방법도 간단하여 SnpEff에 VCF를 인자로 넣어주면, SnpEff 에서 계산하여 annotation을 진행해줍니다.SnpEff 에서 .. 2017. 3. 31.
[오류] 복사 영역과 붙여 넣을 영역의 크기 및 모양이 다릅니다 안녕하세요 한주현입니다 오늘은 엑셀 오류를 해결하는 방법을 소개 해드리려고 합니다 오늘의 오류 복사 영역과 붙여 넣을 영역의 크기 및 모양이 다릅니다. 제대로 붙여 넣으려면 다음 중 필요한 작업을 수행하십시오.- 셀 하나를 클릭한 후 붙여 넣으십시오- 원래 영역과 똑같은 크기 및 모양으로 범위를 선택한 다음 붙여 넣으십시오. 제가 이 오류를 만났을 때는 분명히 아무것도 없는 새 시트에 복사한 것을 붙여넣으려 했기에셀이 조작되거나 하지 않았음에도 불구하고 저러한 오류가 발생하여 무슨 일인가 했습니다 이리저리 오류의 원인을 찾다 보니... 복사할 새 시트의 열 수가 65536이고 복사하는 데이터의 열 수는 86669로 65536개 보다 많았습니다 해결 방법1) 파일을 다른 이름으로 저장하여 확장자를 xls .. 2017. 3. 29.
wANNOVAR - 웹기반 Annotation Tool 안녕하세요 한주현 입니다 한 가지 질문으로 이번 포스트를 시작해 보겠습니다 웹상에서 Chromosome, Position, Ref, Alt 의 정보로 그 지역에 해당하는 gene을 가지고 올 수 있을까요?네 가능합니다 :) 오늘은 웹기반 annotation tool 에 대하여 소개 해드리고자 합니다 URL http://wannovar.wglab.org 1) 먼저 wANNOVAR 에 접속한 화면입니다 2) 스크롤을 내리다 보면 Basic Information 부분이 나오게 되는데요,이곳 입력창에 정보를 채우시면 됩니다 - Email : annotation 이 끝났을 때 결과 알림이 전달 되는 email 주소- Sample Identifier : 샘플을 구별 할 수있는 id- Input File : VCF,.. 2017. 3. 24.
반응형